Lohjanjärven tila on luokiteltu pääasiassa hyväksi. Neljän vuoden (2010-2013) tutkimukset osoittavat, että veden laatu on heikoin tulojokien vaikutusalueilla ja järven sokkeloisissa eteläosissa
Järvessä on kylmää ja pimeää, kun jääkansi eristää sen muusta ympäristöstä. Kalojen aktiivisuus laskee, mutta hajottajat jatkavat työtään. Pakkaskelit ovat oleellisia kunnostustyölle.
Hiidenveden kunnostamista edistävien hankkeiden aikana on rakennettu noin sata kosteikkoa ja laskeutusallasta. Kartoituksessa käydään läpi merkittävimpien kohteiden kunto ja mahdolliset huoltotarpeet.
Haja-asutuksen jätevesien käsittelyllä vähennetään luontoon joutuvien haitallisten aineiden määrää. Asianmukainen jäteveden käsittely estää haitta-aineiden joutumisen juomaveteen, pihapiiriin ja lähivesistöihin. Jätevesijärjestelmän uudistamisessa on useimmiten kyse kymmeniä vuosia vanhojen jätevesirakenteiden korjaamisesta. Epäselvissä tilanteissa neuvoa voi kysyä paikallisilta asiantuntijoilta.